第三季开篇，外科医生安宁第三次穿越到古代。这次她没有穿成医女或宫女，而是直接穿成了当朝太傅的女儿、即将被第三次“赐死”的王妃。前两次穿越留下的记忆让她在古代有了一点“先知”能力，但她发现这里的皇帝——那个要赐死她的人——竟然是她穿越前的医学学霸前男友沈逸。
沈逸先她一步穿越，已经当了三年皇帝，且黑化成冷酷的独裁者。他利用现代知识推行暴政，建立了“新医学”，把反对他的人活体解剖。安宁决定不再逃跑，而是用医学和仁心与他抗衡。她在民间建立地下医院，培养女医，用抗生素配方和外科手术一次次打脸皇家的“新医学”。
最终沈逸被政变推翻，安宁在行刑前用一支青霉素治好了他的败血症，说：“我是医生，你不能死在我面前。”沈逸流着泪说：“下辈子，我不做皇帝了。”
第三季彻底摆脱了前两季的无脑甜宠，转向了“用现代医学对抗暴政”的高概念设定。男女主互为前男友/前女友的设定增加了极强的情感张力。医学细节考究，权谋线智商在线，最后青霉素那场戏堪称全剧高光。甜中带虐，虐完更甜。
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